区中医院是一家以中医针灸为特色的专科医院。有石学敏院士专家工作站、张缙教授传承工作站、方剑乔专家工作站、陈华德专家工作站、薛立功经筋病专科工作室、施茵专家工作站和卵巢早衰工作室。是中国（衢江）中医针灸传承创新试验区（孵化基地）。设有中医针灸减肥美容中心、灸疗中心、药浴中心、中医小儿按摩推拿中心、名中医馆、针灸推拿科、康复科、急诊科、中西医内科、外科、妇科、小儿科、住院病区。以杨继洲针刺手法治疗脾胃病、眼底病、妇科疾病为特色。同时开展了长圆针治疗顽固性关节炎等特色科室。

2019年，建立以区中医院为龙头的区中医院医共体，下辖高家分院、全旺分院、大洲分院、横路分院等6家乡镇卫生院。